Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ilf3Q9Z1X4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms