Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms