Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clip2Q9Z0H8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clip2Q9Z0H8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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