Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf13bQ9WU72 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf13bQ9WU72 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf13bQ9WU72 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms