Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod3Q9R0E1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms