Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms