Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms