Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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