Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms