Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pole3Q9JKP7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Pole3Q9JKP7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Pole3Q9JKP7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pole3Q9JKP7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms