Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms