Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms