Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp29Q9ES63 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms