Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Barx1Q9ER42 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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