Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cxcr6Q9EQ16 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cxcr6Q9EQ16 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cxcr6Q9EQ16 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cxcr6Q9EQ16 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Cxcr6Q9EQ16 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Cxcr6Q9EQ16 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxcr6Q9EQ16 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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