Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Borcs6Q9D6W8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms