Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UvssaQ9D479 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UvssaQ9D479 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms