Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms