Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt20Q9D312 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms