Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D2Q3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms