Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc47Q9D024 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms