Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcbQ9CXT8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms