Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ddx47Q9CWX9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ddx47Q9CWX9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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