Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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