Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sycp2Q9CUU3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms