Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rprd1bQ9CSU0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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