Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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