Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nicn1Q9CQM0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms