Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkp2Q9CQ73 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp2Q9CQ73 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms