Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms