Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms