Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

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Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh23Q99PF4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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