Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cep41Q99NF3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cep41Q99NF3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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