Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NsmfQ99NF2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms