Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl43Q99N89 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl43Q99N89 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms