Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms