Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps4Q99KG7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms