Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrabdQ99JY4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrabdQ99JY4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms