Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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