Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sfxn4Q925N1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sfxn4Q925N1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sfxn4Q925N1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfxn4Q925N1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms