Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip1Q922J3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms