Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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