Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf6Q91YR7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms