Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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