Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms