Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hecw1Q8K4P8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms