Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms