Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrnp27Q8K194 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrnp27Q8K194 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms