Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms