Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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